Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actn1Q7TPR4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actn1Q7TPR4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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