Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nphp3Q7TNH6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms