Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf139Q7TMV1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf139Q7TMV1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf139Q7TMV1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf139Q7TMV1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf139Q7TMV1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf139Q7TMV1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf139Q7TMV1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf139Q7TMV1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf139Q7TMV1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf139Q7TMV1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf139Q7TMV1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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