Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms