Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms