Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfrkbQ6PIJ4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfrkbQ6PIJ4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms