Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms