Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbtb40Q6PCS8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Zbtb40Q6PCS8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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