Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms