Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kdm2bQ6P1G2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms