Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms