Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pram1Q6BCL1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms