Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms