Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms