Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PtprdQ64487 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PtprdQ64487 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PtprdQ64487 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms