Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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SnrpcQ62241 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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SnrpcQ62241 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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SnrpcQ62241 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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SnrpcQ62241 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SnrpcQ62241 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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