Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5dQ62240 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5dQ62240 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5dQ62240 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5dQ62240 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm5dQ62240 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms