Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sin3bQ62141 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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