Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Foxd1Q61345 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Foxd1Q61345 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Foxd1Q61345 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Foxd1Q61345 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Foxd1Q61345 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Foxd1Q61345 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Foxd1Q61345 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Foxd1Q61345 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd1Q61345 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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