Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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JrkQ60976 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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JrkQ60976 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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JrkQ60976 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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JrkQ60976 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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JrkQ60976 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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JrkQ60976 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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JrkQ60976 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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