Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms