Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mkrn3Q60764 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms