Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Samhd1Q60710 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samhd1Q60710 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms