Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms