Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms