Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rbm27Q5SFM8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rbm27Q5SFM8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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