Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1nQ497L1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms