Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lin28bQ45KJ6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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