Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms