Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms