Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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