Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sec31aQ3UPL0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec31aQ3UPL0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms