Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp30Q3UN04 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms