Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp19Q3UJD6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Usp19Q3UJD6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Usp19Q3UJD6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Usp19Q3UJD6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Usp19Q3UJD6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Usp19Q3UJD6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Usp19Q3UJD6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Usp19Q3UJD6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Usp19Q3UJD6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Usp19Q3UJD6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Usp19Q3UJD6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp19Q3UJD6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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