Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Rnf224Q3UIW8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf224Q3UIW8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms