Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zyg11bQ3UFS0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zyg11bQ3UFS0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms