Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Puf60Q3UEB3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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