Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms