Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gtpbp6Q3U6U5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gtpbp6Q3U6U5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gtpbp6Q3U6U5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms