Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Q3U6N9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Q3U6N9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Q3U6N9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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