Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gse1Q3U3C9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gse1Q3U3C9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gse1Q3U3C9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gse1Q3U3C9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gse1Q3U3C9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gse1Q3U3C9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gse1Q3U3C9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gse1Q3U3C9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gse1Q3U3C9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms