Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kdm4dQ3U2K5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms