Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms