Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms