Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYL0

Putative IQ motif and ankyrin repeat domain-containing protein LOC642574 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TYL0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TYL0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3TYL0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms