Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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