Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Shcbp1lQ3TTP0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Shcbp1lQ3TTP0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Shcbp1lQ3TTP0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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