Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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