Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Col24a1Q30D77 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Col24a1Q30D77 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Col24a1Q30D77 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Col24a1Q30D77 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Col24a1Q30D77 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Col24a1Q30D77 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Col24a1Q30D77 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Col24a1Q30D77 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Col24a1Q30D77 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col24a1Q30D77 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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