Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna5Q2MKA5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms